印尼实行总统制。总统为国家元首、政府首脑和武装部队最高统帅。从2004年起，总统和副总统由全民直选，每5年一次。总统任命内阁，内阁对总统负责。

在2014年的总统选举中，时任雅加达省长的佐科与搭档优素福·卡拉获得53.15%的选票，击败普拉博沃及其副手哈达·拉查萨。